Dalam rangka promosi misi dan aktivitasnya, PPSML-UI bekerjasama dengan berbagai institusi, baik di tingkat regional (pusat dan daerah) maupun tingkat internasional; organisasi pemerintah maupun lembaga swadaya masyarakat. PPSML-UI membangun jaringan kerjasama dalam bidang lingkungan, dengan berbagai lembaga pemerintah seperti Kementerian Lingkungan Hidup, Departemen Perindustrian, Perdagangan, Transmigrasi dan Koperasi, Pendidikan Nasional, Perhubungan, Energi dan Sumberdaya Mineral, dan Pemerintah Daerah; seperti berbagai dinas pada Propinsi DKI Jakarta. Dalam hal kerjasama internasional, PPSML-UI bekerjasama dengan UNESCO, berbagai universitas di luar negeri (seperti Griffith University, Australia, Universitas di Inggris; Universitas di Canada, yaitu University of Toronto, York University dan University of Waterloo melalui University Consortium on the Environment/UCE). Selain itu, PPSML-UI bekerjasama pula dengan perusahaan multi nasional. Dalam menyelenggarakan berbagai penelitian, pelatihan, dan pengabdian pada masyarakat, PPSML-UI bekerjasama dengan berbagai institusi baik pemerintah pusat dan daerah, swasta, industri, maupun lembaga swadaya masyarakat.
